شمار زیادی از اعضای اقلیت اویغورهای چین توسط برخی از کشورها بویژه ترکیه، آمریکا و انگلیس برای انجام ماموریت های تروریستی در قالب سازمان هایی مانند جنبش اسلامی ترکستان آموزش و سازمان دهی شده اند. بر اساس برخی گمانه زنی ها، این افراد برای انجام عملیات های تروریستی علیه چین در سال های آتی آماده می شوند. همزمان فعالیت موسسات اویغوری در این کشورها افزایش یافته است. از جمله، کلاس های درس آموزش زبان اویغوری در دانشگاه هاروارد و چندین انجمن اویغوری مانند « جنبش بیداری ملی ترکستان شرقی» در آمریکا ثبت شده و در استانبول نیز دولت ترکیه، آکادمی اویغور را در راستای اهداف پان ترکیستی تاسیس کرده است . برخی محققان با اعتراض به استفاده ابزاری از اقلیت اویغور، معتقدند بین فعالیت این موسسات و افزایش حضور اویغورها در سوریه ارتباط وجود دارد.